分子对接从数周缩短至2小时,北鲲云为新药研发按下加速键

近年来，在政策引导和资金推动下，创新药正成为中外药企的重兵集结地。但据Nature公布的数据显示，新药的研发成本大约是26亿美元，耗时约10年，成功率不到十分之一。如何提高新药研发的速度和效率，是中外药企的核心关注点。

计算机辅助药物设计（computer aided drug design, CADD）的应用极大地加快了新药研发的速度与效率，已成为现代药物研发的常规方法之一。

某上市药企年销售收入超过400亿元，自创立以来，先后投入数十亿元资金进行研发创新，在肿瘤、细菌感染、肠外营养等多个疾病领域相继启动了500余项重大药物的研制。

旗下的CADD部门发展速度迅猛，每年需对数千化合物进行分子对接及结合自由能计算。实际上，化合物的分子库非常大，可能有成百万、上千万甚至上亿的分子。从数据量如此大的数据库中搜寻与受体生物大分子有较好亲和力的小分子，加上计算过程复杂，计算精度要求高，因此不仅需要以现代计算机强大的计算能力为基础，还需要以正确的计算方法和高效的计算策略为支持。

但CADD部门面临着严重的计算资源老化问题，GPU卡多为Nvidia P100，甚至是更早的加速卡，已无法满足高负荷的计算需求，严重影响了新药的研发效率。

2019年，该药企的CADD部门正式接入北鲲云超算平台。通过北鲲云超算平台，把线下计算资源与云上资源进行整合，当本地算力资源不足时，可通过北鲲云超算平台自动溢出到云上，与云上资源无缝对接，从而突破了本地算力不足的桎梏。据CADD部门负责人介绍，“北鲲云平台投入使用后，我们可以并行调动200-400张Nvidia V100卡，分子对接的计算时间从数周缩短至2个小时，计算效率提升100倍，有效地提高了新药开发的速度、缩短新药上市周期。”

(混合模式集群架构)

制药企业拥有着大量的业务敏感数据，如知识产权、临床分析报告、质检报告等。一旦丢失，将会造成巨大的经济和声誉损失。北鲲云通过在网络层面创建独立的VPC网络 ，将CADD部门使用的包括计算、存储及传输在内的所有资源完全独立及隔离。

(企业专属计算区)

在企业专属计算区内还部署FLARE、Schrodinger的Agent服务，用户可直接在本地电脑使用FLARE、Schrodinger的图形界面触发云上分子对接，结合自由能FEP计算，计算结果实时同步至图形界面。

药片虽小，关系重大。随着计算机科学及众多基础学科的发展与进步，基于计算机图形学、数据库技术、人工智能等新技术的药物分子设计手段正日臻成熟，不断取得突破性进展，不仅为药企提高新药研发效率提供了有利的武器，更有力推动了中国药物设计领域日趋完善。

除分子对接外，北鲲云还提供了基因测序、蛋白折叠、虚拟筛选、蛋白结构模拟、分子动力学模拟等应用场景的高性能计算解决方案，助力生命科学领域的研究和发展。

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